Součástí eZdravotnictví musí být i jednoznačná identifikace subjektů v rámci zdravotnictví. Tu zavádí Kmenové registry jako referenční identitu ve zdravotnictví.
Obecně platí, že pokud subjekt není v příslušném kmenovém registru, jakoby neexistoval. Zásadní je to zejména u poskytovatelů a zdravotnických pracovníků.
Co se týče pacientů, ti buď ve kmenovém registru jsou, ale pokud poskytovatel se setká s neevidovaným pacientem, má nově povinnost Zapsat dosud neevidovaného pacienta do kmenového registru.